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梯度膠電泳——蛋白條帶為(wéi)何越跑越銳利(lì)

點擊次數: 更新時間:2024-04-30


還有兩個月就要(yào)迎來畢業季,各位準碩士、準博士們想必已經做完了實驗,正在整理數據,全力準備答辯(biàn),在這裏預祝各(gè)位準(zhǔn)畢業生們畢業(yè)順利。

做了(le)多年WB實驗的同學們想必非(fēi)常熟悉SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)了。在傳統(tǒng)的(de)SDS-PAGE中,欧美91成人网按傳統方式配(pèi)製分層凝膠,先向膠板中灌入分層膠,待分層膠凝固之後再向其中加入濃縮膠,插上用於分隔上樣孔的梳子之(zhī)後等待濃縮膠凝(níng)固之後便可以使用。凝固的聚丙(bǐng)烯酰胺形成了一張三(sān)維立體的網,網眼的疏密與凝膠的密度相關(guān),濃度越高,網眼(yǎn)越密集,蛋白(bái)電(diàn)泳的速度越慢。蛋白先(xiān)從濃縮膠中經過,濃縮膠中的pH值較低,各種不同大小的蛋白以相近的速度(dù)泳動,並不斷堆疊壓縮,待條帶寬度被壓縮到合適的程度,再進入分離(lí)膠中,分離膠的pH值較(jiào)高,SDS-蛋白複合物根據分子量的大小帶上均勻的負電荷(hé),每單位分子量所受的電場力是相當的,因此(cǐ)在電泳(yǒng)中以分子量大小為(wéi)基準分離成各(gè)個條帶,並(bìng)基本保持(chí)了濃(nóng)縮膠壓縮之後的形狀。

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分層膠電泳原理示意


當欧美91成人网使用分層膠進行電泳時,電壓通常不能過(guò)大,電泳的總(zǒng)產熱量正(zhèng)比於電壓的平方,而過熱會導致條帶的寬(kuān)度變寬,與背景的對(duì)比度(dù)降低,進而降低條帶的分辨率。所以(yǐ)分層膠電泳通常是比較緩慢的(de),一般需要90分鍾或以上的(de)時間。並且(qiě)需要根據不同大小的蛋白使用各種不同濃度的聚丙烯(xī)酰胺凝膠。

那麽欧美91成人网有辦法在提高(gāo)電壓加快電泳速度的同時還能(néng)夠使條帶壓縮得(dé)更好,分辨率更高嗎?使用梯度膠不失為一種好辦法。

垂直電泳中梯(tī)度膠是指(zhǐ)從上到下聚丙烯酰(xiān)胺濃度(dù)不斷增大的凝膠,常用的梯度膠濃度範圍為4~12%、4~15%、4~18%及4~20%。梯度膠可以將(jiāng)不同(tóng)大小的蛋白均勻地分(fèn)離開,4~20%的梯度膠(jiāo)可以覆蓋絕大多數(shù)常見的蛋白電泳分離(lí)需求,將不同大(dà)小的蛋白(bái)在不(bú)同濃度的區域進行分離。除了有利於廣分子量範圍的蛋白條帶分離,梯度膠還(hái)有一個重要的(de)性質——蛋(dàn)白條帶的自壓縮。

不知(zhī)道各位讀(dú)者有沒有見過海浪,仔細觀(guān)察會發現海浪的形狀幾乎總是和海岸基線的(de)形狀相同的,近岸的海浪總是平行於海岸的。

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海岸邊一波波湧來的海浪(làng)

這是由(yóu)於海浪作為有限振幅波,其運動速度與海水的深度相關,因為海水越淺,波的振動與傳(chuán)播受到海底泥沙砂石等(děng)固體(tǐ)的影響,就會越慢。當海浪靠近海(hǎi)岸時,前排的海浪會受到越來越淺的海水的影響(xiǎng),移動(dòng)速度逐漸降(jiàng)低,後續的(de)海浪則會縮短與前排海浪的(de)距離,直到它們的波(bō)前重疊在一起,此時海浪的波(bō)前線的形狀就與海水的等深線重合,也與海岸基線(xiàn)重合(因為通常離海岸基線越遠(yuǎn)的海水越深)。

海浪由於越來(lái)越大(dà)的(de)運行阻力而不斷重疊,與海岸基線保持平行的現象,和(hé)梯度膠中蛋白自壓縮的現象頗為相似。梯度膠中蛋(dàn)白從(cóng)上到下電泳(yǒng),不斷從阻力較小的低濃度區域泳動至阻力較大的高濃度區域,並不斷被減速,此時相同大小的蛋(dàn)白所形成的較寬的條帶中,靠後的蛋白處於濃度(dù)較低的(de)區域中,泳動速度較快,而靠前的蛋白則位於濃度較(jiào)高的區域(yù)中,泳動(dòng)速度較慢,隨著電(diàn)泳的持續進行(háng),靠後的蛋白就會縮短與靠前(qián)的蛋白的距離,直到與其重疊,此時條帶的形狀與梯度膠的等(děng)濃(nóng)度線重合,條帶也(yě)被壓縮到非常窄的區域內。

這便是梯度膠電泳中的蛋(dàn)白條帶(dài)自壓縮現象。由於自壓縮所帶來的全程壓(yā)縮(suō),梯度膠可以不用灌製濃縮膠(當然也可以(yǐ)結合濃縮膠和梯度膠來進一步提高壓縮效果),並全程使用200V或以上(shàng)的高電壓進行電泳,電(diàn)泳時間也可以縮短到50min左右,與此同時也能夠保持較好的條帶寬度、對比度,電泳條帶銳利清晰,提高蛋白條帶的分辨(biàn)率。

在(zài)實驗室中手動灌製梯度膠是比較(jiào)困難的,所以各位讀者可以選用中(zhōng)科通儀自動梯度製膠儀進行製作,一鍵灌裝,省(shěng)心省力,助力您的科研事業。

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中科通儀自動梯度製膠儀

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4~18%梯度膠電泳效果示意圖(tú)

上文中通過海浪給各位讀者一個形象描述梯度膠自(zì)壓縮特性的方式,其實類似的現象(xiàng)在很多情況中都有發生,有時未(wèi)必是好事,譬如在戰鬥(dòu)機以亞音速飛行的過程中,戰鬥機機頭推動空氣在機身前方形成了一個(gè)空氣的高(gāo)壓區,機身高速運動所發出(chū)的各(gè)種噪聲以密度波的形式以聲速向前(qián)方傳播,而高壓區中(zhōng)的當(dāng)地聲速高於機頭高壓區更前方還未被擾動的空氣中的聲速(sù),此時不斷因為(wéi)速度更快而追上機頭高壓區的聲波便堆積形成(chéng)了一堵以聲速運動、高(gāo)溫(wēn)高壓的空氣牆,也就是所謂的音障,這極大地阻礙(ài)了戰鬥機的進一步提速,同時也會對機身的材料及結構剛性提出更高要求。


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即將突破音障(zhàng)的超音速戰機

從亞音速飛行的戰鬥機前方(fāng)的音障,到平行於海(hǎi)岸傳(chuán)播的海浪(làng),再到梯度膠中自壓(yā)縮的蛋白條帶,物理學的原理無分大小,規製著整個物質世界的運行。

感謝各位讀者的閱讀(dú),再次預祝各位準畢業生們順利畢業,前(qián)方一(yī)路坦途。



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